硝化细菌是一类好氧性细菌，包括亚硝酸菌和硝酸菌。可以将它制成硝化细菌处理剂，用于控制养殖池水自生氨浓度，使用时可直接将该剂散布于池中，很快就能发挥除氨的功效。硝化细菌与人类的关系十分密切，农业上可通过深耕、松土提高细菌活力，从而增加土壤肥力。在使用硝化细菌时，为了避免净水细菌被杀灭，切记勿与消毒杀菌药剂使用。
硝化细菌广泛存在于自然环境中。其存活需要水分及氧气，只有满足水分与氧气的供应才能存活。在泥土、沙粒、生化棉、陶瓷环等各种有微孔的滤材中更宜于大量繁殖。硝化细菌最适宜在弱碱性的水中生活，在温度达到25度左右时生长繁殖最快。
